女性在进行肛门灌肠的时候一定要注意不能使用对肠粘膜有腐蚀作用的药品，并且灌肠头在插入肛管的时候，手法要轻，避免动作粗鲁擦伤直肠黏膜。如果本身有痔疮的话，应当慎重考虑灌肠这种治疗方法，最好还是不用。如果女性是在月经期、妊娠期，尤其妊娠早期禁止灌肠。
灌肠的时候尽可能的保持头低足高的卧位，液体平面距离肛门约30厘米左右，灌肠的最佳时间是晚上睡觉以前。而且灌完药水以后，要继续躺在床上30分钟左右，以利于药物吸收。灌肠的时候要注意一下药液的温度，要控制在38－39度之间，过高过低都是不合适的，因为如果过低的话，会使肠蠕动增强引起腹痛的症状，如果药液温度太高有可能烫伤肠粘膜或者造成肠管的扩张，而且在肠道保留不了。在灌肠过程中，如果患者出现心慌气促等症状，要立即停止灌肠并且平卧，避免意外发生。
